V daňovom poriadku som našla odpoveď na podobnú otázku:

V prípade, ak je daňový subjekt už registrovaný u správcu dane a dôjde k zmene konateľa spoločnosti a predmetná zmena je zapísaná v obchodnom registri (údaje sú dostupné z OR), predmetnú zmenu nie je povinnosť správcovi dane oznámiť. Avšak ak ešte údaj nie je zverejnený a predmetná informácia nie je známa správcovi dane, odporúčame zmenu konateľa oznámiť z dôvodu zamedzenia nezrovnalostí, ktoré môžu nastať pri správe daní.

Na daňový úrad sa neviem dovolať, máte s tým skúsenosť ?