...keď sa odpíše celá zostatková hodnota stroja a predá sa len za zvyšnú sumu.... - za akú zvyšnú sumu? Pri 2. odpisovej skupine po prvom roku odpisovania?

Podľa toho, čo uvádzaš, je tento problém dvoma stranami jednej mince. Na jednej strane je objem ročných nákladov z odpisov stroja voči vysokému zisku z prenájmu u jednej firmy, na druhej strane sú vysoké náklady za prenájom u druhej firmy, čo mohlo „napomôcť“ k optimalizácii základu jej dane, resp. aj dosiahnutiu toho, aby sa taký drahý stroj dostal cez prenájom do nákladov za jeden rok. Je taký vysoký prenájom vôbec cenou obvyklou? A navyše po roku došlo k odkúpeniu predmetu prenájmu. A ak sú tieto firmy ešte aj prepojené, tak to „niečím“ zaváňa. Takéto „podnikateľské“ správanie majú už daniari „prečítané“. Aj z takýchto dôvodov sa od roku 2015 zaviedlo v zákone transferové oceňovanie aj pre tuzemské firmy.
A čo má s tým spraviť účtovník? Myslím, že aj keby sa akýmkoľvek spôsobom „optimalizoval“ základ dane, tak tento konkrétny prípad prenájmu stroja je veľmi čitateľný. To je môj dojem .

ad Vianocka: "....druhej strane sú vysoké náklady za prenájom u druhej firmy, čo mohlo „napomôcť“ k optimalizácii základu jej dane,..."

... ľudia sú proste vynaliezaví. Zákonodárca však na takúto "optimalizáciu dane" pamätal v zákone:
§17,ods.24 písm.b) ZoDP:
"po skončení nájmu bez vopred dohodnutého práva kúpy prenajatej veci ku kúpe prenajatej veci za kúpnu cenu nižšiu, ako je jej zostatková cena podľa § 25 ods. 3, sa základ dane zvýši o kladný rozdiel už uplatneného nájomného v daňových výdavkoch a odpisov, ktoré by mohol vlastník uplatniť z tohto majetku počas trvania nájomnej zmluvy podľa § 27 a o tento rozdiel sa zvýši vstupná cena obstarávaného majetku."