Faktúru zaúčtuješ ako dovoz z tretích krajín, čiže bez DPH (bez KV DPH), tá sa vyčísľuje na JCD.
Predpokladám, že ste tovar preclili a teda máš JCD, kde je vyčíslená DPH (plus prípadné clo), ktorá sa odvedie colnému úradu a potom na DP k DPH vynárokuje späť.