Predpokladám že auto má firma v dlhodobom prenájme, nie že si ho spoločník prenajme na pár dní niekde v cieľovej destinácii /to by bolo v cesťáku/. Podľa mňa spotrebu treba účtovať rovnako ako keby vozidlo bolo vo Vašom majetku, čiže 501AE a 343AE na uplatnenie DPH, treba tak isto sledovať spotrebu voči najazdeným kilometrom a priemernej spotrebe auta. Ak Váš zamestnanec alebo spločník použije toto auto na SC a bude tankovať, tak by som bločik za PHM preplatil zvlášť, a na SC dal len diety.
Nevidím ale problém ak to software umožňuje dať PHM do SC a v ňom rozúčtovať DPH k PHM, len je treba PHM účtovať na 501AE a nie 512AE.