V JU nie sú pojmy náklady a výnosy, ale príjmy a výdavky. To potom vlastne charakterizuje aj jeden z rozdielov JU a PU. V PU idú náklady a výdavky do obdobia s ktorým súvisia, ale v JU iba ak sú aj zaplatené. Tam sa príjmy a výdavky priraďujú k obdobiu, kedy boli zaplatené.
Teda ak v JU PHM za min.rok budú fyzicky preplatené v januári 2006, idú do r.2006.